依照《国家工程研究中心暂行管理办法》，在科技部的领导下，在湖北省科技厅、武汉市科技局等地方部门具体指导下，以中国地质大学（武汉）为依托单位，武汉中地数码科技有限公司、中国科学院地理科学与资源研究所为合作建设单位，组建国家地理信息系统工程技术研究中心。工程中心设立管理委员会和工程技术委员会，负责重大事务决策以及工程技术发展决策管理。工程中心内部设立运营管理部、共性技术部、工程技术部、公共服务部、产业化基地等。

工程中心组织机构图